[Karsh]

Про "два" реестра я знаю. Но работаю с веткой HKEY_CLASSES_ROOT, а она, как я понял, не дублируется. Да и странно, что для папок запись проходит нормально, а для файлов - нет.
И я заметил, что 64-битная версия все же меняет в реестре записи для файлов, но не так как надо.
Я создаю в ветке типа файла ветку "shellex", потом там же ветку "ContextMenuHandlers", в ней еще ветку с названием программы и устанавливаю в ее значение мой CLSID. В 32-битной версии все так и получается, а вот в 64-битной ветка "shellex" вообще не создается, а вот значение у главной ветки типа файла (иными словами описание типа файла в проводнике) заменяется на мой CLSID.