[lmikle]

Судя по java коду, там первые 8 интов идут размеры входа и выхода.
Если не ошибаюсь, то int в java это 32 бита, т.е. 4 байта.
Попробуй от потока отрезать перыве 32 байта, а остаток подсунуть ZLib'у.