имхо багтрекер итп переложить на плечи каково-нибудь github, а чего там не хватает, сделать на отдельном сайте штаб-квартире
например вот такую штуку
http://ru.wikipedia.org/wiki/Диаграмма_связей на каждый проект, с открытой возможностью добавления веток (я такую хочу попробовать сделать)