[zip000]

Попробуй использовать буферизацию, т.е. не считывать каждый раз по 1 Longword, а создать входной буфер на 10-100 кб и считывать из файла сразу по 10-100кб, затем шифровать все данные из буфера и полученный результат тоже записывать целикм.