если файлы текстовые то попробуй что-то вроде этого:
Код:
procedure TForm1.Button1Click(Sender: TObject);
var
S1, S2: TStringList;
begin
S1:= TStringList.Create;
S2:= TStringList.Create;
S1.LoadFromFile('C:\File1.txt');
S2.AddStrings(S1);
S2.Add('some string');
S1.LoadFromFile('C:\File2.txt');
S2.AddStrings(S1);
S1.Free;
S2.SaveToFile('TargetFile.txt');
S2.Free;
end;