[lmikle]

У тебя в корне неправильно делается.
Входной файл должен быть открыть 1 раз. Далее ты должен в цикле взять данные куда-то из него и обработать. По результатам обработки ты должен решить - надо ли продолжать цикл и с какими параметрами. Все.