обычно полноэкранные приложения имет стил "по верх всех окон", может из-за этого и появляется данная проблема.
попробуйте сделать так:
Код:
var
EStyle: DWORD;
begin
EStyle:= GetWindowLong(Handle, GWL_EXSTYLE);
SetWindowLong(Handle, GWL_EXSTYLE, EStyle or WS_EX_TOPMOST);
но я не уверен, что поможет...