http://www.wasm.ru/article.php?article=apihook_1
http://www.wasm.ru/article.php?article=apihook_2
http://www.wasm.ru/article.php?article=apihook_3
Это вообще по перехвату api... но честное слово, это довольно трудоемко, + вам прийдется ставить хук на создание процессов и загружать в каждый свою dll что бы перехватить вызов + анализировать параметры передаваемые на перехватываемые GDI функции что бы понять работает приложение со своим окном или со всем экраном + код не должен содержать ошибок!
Я сказал есть пути решения вышей задачи, но это, ой, какой геморой.
Вариант с прозрачностью работает в большинстве случаев и в сравнении с первым, вообще не требует усилий.