Кавычки в батнике и в Дельфи интерпретируются несколько по-разному.
Код:
PChar('C:\Program Files\Java\jre6\bin\java.exe' + ' -Xms1024m -Xmx1024m -cp "%APPDATA%\logsfile\*" -Djava.library.path="%APPDATA%\logsfile\files" net.soft.client.progtam "Neom"'),
Вы хоть копируйте внимательно.