Всё-таки вы не понимаете принцип работы OpenGL. В нём нет команд стереть объект (линию), при не надобности, объект просто не рисуется.
Код:
function DrawGLScene : Boolean;
begin
// Очистить сцену и буфер глубины
glClear(GL_COLOR_BUFFER_BIT or GL_DEPTH_BUFFER_BIT);
glLoadIdentity; // Сбросить текущую матрицу
...
if isDrawLine then
DrawLine; // рисовать нужное
...
end;